2007-08 sezonunda Fenerbahçe'yi Atatürk Olimpiyat Stadı'nda 2-0 yenen Medipol Başakşehir, 2009-10 ve 2012-13 sezonlarında Beşiktaş ile Atatürk Olimpiyat Stadı'nda 1-1 berabere kalırken 2011-12 sezonunda Atatürk Olimpiyat Stadı'nda Galatasaray'ı 2-0 mağlup etmişti. Başakşehir 2016-17 sezonunda da ilk haftada Fenerbahçe'yi sahasında 1-0 yenmeyi başardı.
