Teknik direktörlük kariyerine 1988-1989 sezonunda Trazonspor ile başlayan 63 yaşındaki Güneş, Türkiye'nin en üst düzey liginde bordo-mavili takımın yanı sıra Boluspor, Antalyaspor, Sakaryaspor, Bursaspor ve Beşiktaş'ı çalıştırdı.
Siyah-beyazlı ekibin şampiyonluk ipini göğüslemesiyle birlikte tecrübeli teknik adamın, uzun kariyerindeki şampiyonluk hasreti sona erdi.
