BEŞİKTAŞ'ın peşinde olduğu Rafael, Lyon forması ile üç sezonda tam 99 resmi karşılaşmaya çıktı. 27 yaşındaki sambacı bu karşılaşmalarda 2 gol atarken, 10 da asist yaptı ve toplam 12 gole direkt olarak katkıda bulundu. Lyon'dan önce 170 kez M. United A takım formasını giyen Rafael, İngiltere'de de 5 gol attı, 15 de asist yaptı.