İkinci Lig takımlarından Soma Linyitspor'da futbola başladı. Altay’ın seçmelerine katılmak için 20 km. yürüdü. Seçmelerden Altay'ın futbolcusu olarak döndü.
1992-93 sezonunda Altay forması giydi. Gösterdiği başarılı performans sonrası dönemin Ümit Milli Takım Teknik Direktörü Fatih Terim tarafından kadroya alındı.
Atina'da düzenlenen Akdeniz Oyunları'nda Olimpik Milli Takım formasıyla 4 maça çıktı. Ümit Milli Takım'ın değişmez oyuncusu olurken, büyük kulüplerin dikkatini çekmeyi başardı.
1993 yılında dönemin Beşiktaş Kulübü Başkanı Süleyman Seba tarafından transfer edildi.
Siyah-beyazlı takımdaki ilk sezonunda 11 maçta görev aldı. Fiziği ve kazanma hırsıyla teknik direktör Milne ve Christoph Daum'un değişmez oyuncusu oldu.
1996'da yapılan ve 2-2 sonuçlanan Fenerbahçe-Beşiktaş TSYD Kupası maçında Tarık ile kavga edince takımını 10 kişi bıraktı.
Yine 2-2 biten kupa maçında hakeme itirazdan kırmızı kart gördü. Denizlispor maçında rakibe sert hareketten dolayı oyundan atıldı.
Böylece 6 ayda 3 kırmızı kart görerek rekor kırdı. 1999'da F.Bahçe-G.Saray maçında attığı gol, İstanbul TSYD Kupası tarihinin son golü olarak tarihe geçti.
Milli Takım'ın tarihinde ilk kez katıldığı Avrupa Şampiyonası EURO 96'da oynadığımız Hırvatistan maçının 87. dakikasında Hırvat forvet Goran Vlaovic'e faul yapmadı.
Topu Türkiye ağlarına gönderen rakibini düşürmediği için eleştirildi. Bu hareketi nedeniyle UEFA tarafından 'Fair Play' ödülüne layık görüldü.
Dönemin ünlü magazin programı Televole'de, havuz başında manken Cansel Özzengin'e ilan-ı aşk etti.
Cansel, konuyla ilgili görüşlerini soran muhabire, "Takla atarken kafasını havuzun kenarına carpmış olmalı" demesine rağmen 1997 yılında Alpay'la evlendi.
Birlikte açtıkları çocuk yuvasının duvarlarına tehdit sloganları yazılınca işlerini tasfiye ettiler.
6 sezon Beşiktaş'ta oynadı. Siyah-beyazlı takımda Türkiye Ligi Şampiyonluğu, 2 Türkiye Kupası ve Cumhurbaşkanlığı Kupası sevinci yaşadı. Beşiktaş forması altında 148 maça çıktı, 9 gol attı.
Rekor bonservis bedeli (2 trilyon 600 milyar TL) karşılığında Siirt Jetpaspor'a imza attı.
Siirt’e gitmeden Fenerbahçe’ye kiralandı. Sarı-lacivertli formayla çıktığı ilk Beşiktaş maçında, siyah-beyazlı taraftarlar 90 dakika boyunca eşine küfürlü tezahürat yaptı.
1998 yılında 'Titan'cı Ahmet Hakan Baz'a satıp parasını alamadığı Ferrari marka otomobiline maliye el koydu. Kredi borcu nedeniyle evine haciz geldi. Alpay, fiyatı 50 milyarı bulan lüks otomobilini almak için dava açtı.
Kontrol altına alamadığı hırsı Türkiye'yi çeyrek finalden etti. EURO 2000’de Portekiz'le oynadığımız maçın 29. dakikasında üzerine düşen Portekizli Couto'ya yumruk atmaya teşebbüs edince, kırmızı kart gördü ve 2-0'lık mağlubiyetin sorumlusu oldu.
F.Bahçe'de tam bir görev adamı olduğunu gösterdi ve 2000-01 sezonunda İngiltere'nin köklü takımı Aston Villa'ya transfer oldu. Geçirdiği sakatlık nedeniyle beş ay futboldan uzak kaldı. İngiliz ekibi ile 52 maça çıktı, bir de gol attı.
2002 Dünya Kupası Elemeleri'nde oynadığımız Makedonya maçında hat-trick yaptı. Türkiye-Brezilya maçının uzatma dakikalarında penaltı yaptırdı ve kırmızı kart gördü. Türk Milli Takımı'nı Dünya Üçüncülüğüne taşıyan efsane kadroda yer aldı.
Güney Kore'de alınan tarihi başarı sonrası tekrar büyük kulüplerin transfer listesine girdi.
2004-05 sezonunda Fenerbahçe'nin eski teknik direktörü Werner Lorant'ın çalıştırdığı Güney Kore ekibi Incheon United'la 2 yıl için 2 milyon dolar karşılığında sözleşme imzaladı.
Incheon formasıyla çıktığı 10 maçta gol atma başarısını gösteremedi.
2005'de Japonya’nın Urawa Reds Kulübü ile el sıkıştı. Uruwa'da şampiyonluk kupasını kaldırırken, 7 haftada 3 kırmızı kart görmesi nedeniyle