2001-02 sezonunun yarısında Fransa 1. Ligi takımlarından Guingamp'ın yolunu tutan yıldız futbolcu, 100 bin euro'ya transfer oldu. Yarım sezonda 11 maça çıkan Fildişili forvet, 3 gol kaydetti. Bu performansı Guingamp'ı küme düşmekten kurtardı. Ancak teknik ekip bir türlü bu genç golcüye güvenemiyordu. 2002-03'te 34 karşılaşmaya çıkan Drogba 17 gol kaydederek takımının ligi 7. bitirmesini sağladı.
Golcü futbolcunun, Guingamp'tan takım arkadaşı Florent Malouda ile uyumu ileriki yıllarda Chelsea'de yollarının kesişmesini sağlayacaktı. Drogba o sezon toplamda 39 karşılaşmada 21 gol attı. 1.5 sezonluk Guingamp macerasında ise 50 mücadelede 24 kez fileleri sarstı. Guingamp'tan haftada 1.600 euro kazanan yıldız oyuncu gösterdiği bu performansının karşılığını 3.5 milyon euro'ya Marsilya'ya transfer olarak alacaktı.
Didier Drogba, Marsilya'ya gittikten sonra çok başarılı bir sezon geçirdi. Marsilya Teknik Direktörü Alain Perrin'in baş oyuncularından olan Fildişi Sahilli yıldız, ligde 35 maçta attığı 19 golle 'Profesyonel Futbolcular Ulusal Birliği' tarafından 'Yılın Oyuncusu' seçildi. Şampiyonlar Ligi'nde 5 gol ve Avrupa Ligi'nde 6 gol, toplam 11 golle 2003-04'te UEFA'nın en skorer ismi oldu. Aynı sezon Fransa'da 'Yılın golü', 'Yılın Takımı', 'Yılın oyuncusu' ödüllerini kucakladı.
Marsilya ile Avrupa Ligi'nde final oynama başarısı gösterirken, Fransız magazin dergisi Onze d'Or tarafından Theirry Henry ve Ronaldinho'yu geçerek 'Avrupa'da Yılın Futbolcusu' seçildi. Drogba, 1 sezon oynadığı Marsilya'da 55 maçta 32 gol kaydetti.
