Bu sezon mücadele ettiği 3 kulvarda da iddialı bir şekilde yoluna devam eden Fenerbahçe, Avrupa kupalarında çıktığı 16 maçta 8 kez kazanırken, 6 maçı berabere tamamladı, 2 maçta ise yenildi.
Sezona, UEFA Şampiyonlar Ligi 3. eleme turunda Romanya'nın Vaslui takımıyla yaptığı mücadeleyle başlayan ''Sarı Kanarya'', ilk maçta İstanbul'da 1-1 berabere kaldığı rakibini deplasmanda 4-1 yenerek play-off turuna yükseldi.
Play-off turunda Rus ekip Spartak Moskova'nın rakibi olan Fenerbahçe, deplasmanda 2-1 yenildiği rakibi karşısında İstanbul'da 1-1 berabere kalınca ''Devler Ligi''nden elendi.
BAŞARIYI AVRUPA LİGİ'NDE BULDU
Grupta Kadıköy'de çıktığı ilk maçta Olympique Marsilya karşısında sahadan 2-2 beraberlikle ayrılan sarı-lacivertliler ardından grupta üst üste 4 maçını kazanarak son maç öncesi 13 puanla grup liderliğini garantiledi ve son maçında Borussia Mönchengladbach karşısında yedeklerle çıktığı maçta 3-0 yenildi.
Son 32 takımın yer aldığı 2. turda Belarus'un BATE Borisov takımı karşısında deplasmandan 0-0'lık sonuçla dönen Fenerbahçe, kendi sahasında 1-0'lık galibiyetle tarihinde ilk kez son 16 takımın yer aldığı 3. tura çıktı.
Bu turda da Çek Cumhuriyeti'nin Viktoria Plzen takımına rakip olan ''Sarı Kanarya'', ilk maçta deplasmanda 1-0 yenip, ikinci maçta Kadıköy'de 1-1'lik beraberlikle, yine bir ilki gerçekleştirip çeyrek finali gördü.
Fenerbahçe son olarak çeyrek final turunda İtalya'nın Lazio takımı karşısında ilk maçta İstanbul'da 2-0'lık avantajlı bir skor alıp, deplasmanda 1-1 berabere kalarak yarı finale yükseldi.
2012-2013 SEZONU AVRUPA KUPASI MAÇLARI
UEFA Şampiyonlar Ligi 3. eleme turu:
Fenerbahçe-Vaslui............: 1-1 (Bekir İrtegün)
Vaslui-Fenerbahçe............: 1-4 (Caner Erkin, Kuyt 2, Sow)
UEFA Şampiyonlar Ligi play-off turu:
Spartak Moskova-Fenerbahçe...: 2-1 (Kuyt)
Fenerbahçe-Spartak Moskova...: 1-1 (Sow)
UEFA Avrupa Ligi:
Fenerbahçe-Olympique Marsilya: 2-2 (Caner Erkin, Alex)
B.Mönchengladbach-Fenerbahçe.: 2-4 (Cristian 2, Meireles, Kuyt)
AEL Limassol-Fenerbahçe......: 0-1 (Egemen Korkmaz)
Fenerbahçe-AEL Limassol......: 2-0 (Kuyt, Sow)
Olympique Marsilya-Fenerbahçe: 0-1 (Bekir İrtegün)
Fenerbahçe-B.Mönchengladbach.: 0-3
BATE Borisov-Fenerbahçe......: 0-0
Fenerbahçe-BATE Borisov......: 1-0 (Cristian (P)
Viktoria Plzen-Fenerbahçe....: 0-1 (Webo)
Fenerbahçe-Viktoria Plzen....: 1-1 (Salih Uçan)
Fenerbahçe-Lazio.............: 2-0 (Webo, Kuyt)
Lazio-Fenerbahçe.............: 1-1 (Caner Erkin)