Bu sezon mücadele ettiği 3 kulvarda da iddialı bir şekilde yoluna devam eden Fenerbahçe, Avrupa kupalarında çıktığı 16 maçta 8 kez kazanırken, 6 maçı berabere tamamladı, 2 maçta ise yenildi.
Sezona, UEFA Şampiyonlar Ligi 3. eleme turunda Romanya'nın Vaslui takımıyla yaptığı mücadeleyle başlayan ''Sarı Kanarya'', ilk maçta İstanbul'da 1-1 berabere kaldığı rakibini deplasmanda 4-1 yenerek play-off turuna yükseldi.
Play-off turunda Rus ekip Spartak Moskova'nın rakibi olan Fenerbahçe, deplasmanda 2-1 yenildiği rakibi karşısında İstanbul'da 1-1 berabere kalınca ''Devler Ligi''nden elendi.
BAŞARIYI AVRUPA LİGİ'NDE BULDUUEFA Şampiyonlar Ligi'nden play-off turunda elenince yoluna UEFA Avrupa Ligi'nde devam etme hakkı kazanan Fenerbahçe, başarılı bir grup mücadelesinin ardından istikrarlı bir şekilde başarısını yukarıya taşıdı.
Grupta Kadıköy'de çıktığı ilk maçta Olympique Marsilya karşısında sahadan 2-2 beraberlikle ayrılan sarı-lacivertliler ardından grupta üst üste 4 maçını kazanarak son maç öncesi 13 puanla grup liderliğini garantiledi ve son maçında Borussia Mönchengladbach karşısında yedeklerle çıktığı maçta 3-0 yenildi.
Son 32 takımın yer aldığı 2. turda Belarus'un BATE Borisov takımı karşısında deplasmandan 0-0'lık sonuçla dönen Fenerbahçe, kendi sahasında 1-0'lık galibiyetle tarihinde ilk kez son 16 takımın yer aldığı 3. tura çıktı.
Bu turda da Çek Cumhuriyeti'nin Viktoria Plzen takımına rakip olan ''Sarı Kanarya'', ilk maçta deplasmanda 1-0 yenip, ikinci maçta Kadıköy'de 1-1'lik beraberlikle, yine bir ilki gerçekleştirip çeyrek finali gördü.
Fenerbahçe son olarak çeyrek final turunda İtalya'nın Lazio takımı karşısında ilk maçta İstanbul'da 2-0'lık avantajlı bir skor alıp, deplasmanda 1-1 berabere kalarak yarı finale yükseldi.
2012-2013 SEZONU AVRUPA KUPASI MAÇLARIFenerbahçe'nin bu sezon Avrupa kupalarında yaptığı maçların sonuçları ve golleri atanlar şöyle:
UEFA Şampiyonlar Ligi 3. eleme turu:
Fenerbahçe-Vaslui............: 1-1 (Bekir İrtegün)
Vaslui-Fenerbahçe............: 1-4 (Caner Erkin, Kuyt 2, Sow)
UEFA Şampiyonlar Ligi play-off turu:
Spartak Moskova-Fenerbahçe...: 2-1 (Kuyt)
Fenerbahçe-Spartak Moskova...: 1-1 (Sow)
UEFA Avrupa Ligi:
Fenerbahçe-Olympique Marsilya: 2-2 (Caner Erkin, Alex)
B.Mönchengladbach-Fenerbahçe.: 2-4 (Cristian 2, Meireles, Kuyt)
AEL Limassol-Fenerbahçe......: 0-1 (Egemen Korkmaz)
Fenerbahçe-AEL Limassol......: 2-0 (Kuyt, Sow)
Olympique Marsilya-Fenerbahçe: 0-1 (Bekir İrtegün)
Fenerbahçe-B.Mönchengladbach.: 0-3
BATE Borisov-Fenerbahçe......: 0-0
Fenerbahçe-BATE Borisov......: 1-0 (Cristian (P)
Viktoria Plzen-Fenerbahçe....: 0-1 (Webo)
Fenerbahçe-Viktoria Plzen....: 1-1 (Salih Uçan)
Fenerbahçe-Lazio.............: 2-0 (Webo, Kuyt)
Lazio-Fenerbahçe.............: 1-1 (Caner Erkin)
