UEFA Avrupa Ligi'nde toplam 93 gol atan ''Sarı Kanaryalar'', kalesinde 103 gol gördü.
UEFA performansı
Sarı-lacivertliler, 1971-1972, 1972-1973, 1973-1974, 1976-1977, 1977-1978, 1980-1981, 1984-1985, 1990-1991, 1992-1993, 1994-1995, 1995-1996, 1997-1998, 1998-1999, 1999-2000, 2002-2003, 2004-2005, 2006-2007, 2009-2010 ve 2010-2011 sezonlarında UEFA Kupası veya sonradan değişen adıyla UEFA Avrupa Ligi organizasyonlarında yer aldı.
Fenerbahçe'nin UEFA Avrupa Ligi'nde yaptığı maçlarda aldığı sonuçların tablosu şöyle:
Organizasyon O G B M A Y
-------------------------------------------
UEFA Kupası 54 18 10 26 72 91
UEFA Avrupa Ligi 14 7 4 3 21 12
-------------------------------------------
Toplam 68 25 14 29 93 103
En iyi derece son 32 takım arasında yer almak
Avrupa kupaları mücadelesinde en başarılı sezonunu, Arthur Zico yönetiminde Şampiyonlar Ligi'nde çeyrek finale çıktığı 2007-2008 sezonununda geçiren Fenerbahçe'nin, UEFA arenasındaki en iyi derecesi son 32 takım arasına kalmak oldu.
2004-2005 sezonunda Şampiyonlar Ligi'nde 1. turdaki grupta 3. sırada yer alıp yoluna UEFA'da devam eden sarı lacivertliler, 3. turda (32'ler turu) kupaya veda etti. Bu turda İspanya'nın Real Zaragoza takımıyla eşleşen Fenerbahçe, İstanbul'da 1-0 yenildiği rakibine deplasmanda da 2-1 mağlup olunca, kupadan elendi.
2006-2007 sezonu
2006-2007 sezonunda mücadele ettiği Şampiyonlar Ligi'nde 3. eleme turunu geçemeyen sarı-lacivertliler Avrupa kupalarına UEFA'da devam etti.
1. turda başladığı mücadelede 2. turdaki grubu da geçip 3. tura (32'ler turu) kadar yükselen sarı-lacivertliler, bu turda Hollanda'nın AZ Alkmaar takımı karşısında 3-3 ve 2-2'lik skorlarla kupaya veda etti.
Yer aldığı (H) Grubu'nu 3. sırada bitirerek bir üst tura çıkan Fenerbahçe'nin performansı şöyle:
(H) Grubu O G B M A Y P
----------------------------------------------------------
1. Newcastle United 4 3 1 0 4 1 10
2. Celta Vigo 4 1 2 1 4 4 5
3. Fenerbahçe 4 1 1 2 5 4 4
4. Palermo 4 1 1 2 3 6 4
5. Eintracht Frankfurt 4 0 3 1 4 5 3
2009-2010 sezonu
2009-2010 sezonunda UEFA Avrupa Ligi'nde yer alan Fenerbahçe, 3. eleme turundan başladığı mücadeleyi son 32 takım arasına kalana kadar taşıdıysa da bu turda elendi.
3. eleme turu ve play-off turunu geçerek gruplara kalan sarı-lacivertliler, (H) Grubu'nu 15 puanla ilk sırada tamamlayarak 32'ler turuna çıktı. Sarı-lacivertlier bu turda Fransa'nın Lille takımına 2-1'lik yenilgi ve 1-1'lik beraberlik elendi.
(H) Grubu O G B M A Y P
----------------------------------------------------------
1. Fenerbahçe 6 5 0 1 8 3 15
2. Twente 6 2 2 2 5 6 8
3. Sheriff 6 1 2 3 4 5 5
4. Steaua Bükreş 6 0 4 2 3 6 4
