Atletico Madrid'e kiralık gelen Courtois, başarılı geçen sezonun ardından bir yıl daha İspanyol kulübünde kaldı. 20 yaşındaki genç kaleci, geçen sezon La Liga'da 37, UEFA Avrupa Ligi'nde 15 maçta Atletico'nun kalesini korudu.
Bu arada Atletico Madrid, defans oyuncusu Alvaro Dominguez'i ise Almanya'nın Borussia Moenchengladbach takımına verdi.
