Sarı-lacivertli formayla 4. sezonunu geçiren Bekir'in bu sezon attığı 3 gol, takımına ligde galibiyeti, Avrupa kupalarında bir maçta turu, bir maçta da beraberliği getirdi.
Fenerbahçe'nin bu sezon ilk Avrupa sınavında, UEFA Şampiyonlar Ligi 3. eleme turunda Romanya'nın Vaslui ekibiyle Kadıköy'de yaptığı ve 1-0 geriye düştüğü karşılaşmanın 90. dakikasında gol atan Bekir, takımını yenilgiden kurtardı.
UEFA Avrupa Ligi (C) Grubu'ndaki 5. maçında Fransa'nın Olympique Marsilya takımıyla deplasmanda kritik bir maça çıkan Fenerbahçe, 39. dakikada Bekir'in röveşata golüyle 1-0 kazanıp, son maçlar öncesi lider olarak gruptan çıkmayı garantiledi.
Marsilya deplasmanında attığı şık golle taraftarların ''Zlatan Bekirovic'' lakabını taktığı sarı-lacivertli oyuncu, Spor Toto Süper Lig'de de İstanbul Büyükşehir Bediyespor maçında 79. dakikada 1-1'lik eşitliği bozarak Fenerbahçe'ye 3 puanı getiren isim oldu.
-2009-2010 sezonunda Kasımpaşa maçını kazandırdı-
Bekir, 2009-2010 sezonunda Fenerbahçe formasıyla ilk golünü attığı Kasımpaşa maçını takımına kazandıran isim olmuştu.
Sarı-lacivertliler, Recep Tayyip Erdoğan Stadı'nda gol bulmakta zorlandığı 31. hafta mücadelesinde 76. dakikada sahneye çıkan savunma oyuncusunun golüyle kazanıp, Bursaspor'un önüne geçerek 67 puanla liderliğe yükselmişti.
Bekir İrtegün sarı-lacivertli formayla diğer golünü ise 2010-2011 sezonunda ligin 33. haftasında Fenerbahçe'nin Kadıköy'de Ankaragücü'nü 6-0 yendiği maçın 73. dakikasında attı.
-Bekir, takım içi rekabette önde gidiyor-
Yobo ve Egemen Korkmaz'ın sakatlığı bulunduğu maçlarda aldığı şansları iyi değerlendirerek, teknik direktör Aykut Kocaman'ın vazgeçmediği isimlerden biri olan Bekir, attığı önemli gollerle de yerini iyice sağlamlaştırdı.
Bekir, Fenerbahçe'nin son 13 resmi maçında, yedek ağırlıklı kadrolarla çıktığı Pendikspor ve Borussia Mönchengladbach mücadelelerinin haricindeki 11 karşılaşmada ilk 11'de yer aldı.
Bekir İrtegün'ün Fenerbahçe formasıyla resmi maçlarda attığı 5 gol şöyle:
2012-2013 sezonu:
Fenerbahçe-İstanbul Büyükşehir Belediyespor: 2 - 1
Olympique Marsilya-Fenerbahçe..............: 0 - 1
Fenerbahçe-Vaslui..........................: 1 - 1
2010-2011 sezonu:
Fenerbahçe-Ankaragücü......................: 6 - 0
2009-2010 sezonu:
Kasımpaşa-Fenerbahçe.......................: 0 - 1
