Sarı-lacivertli ekip, UEFA Şampiyonlar Ligi için katıldığı 9 eleme turunun 3'ünde turu geçemezken, UEFA Kupası ve UEFA Avrupa Ligi için boy gösterdiği 6 eleme turunda ise sadece bir kez kupa dışında kaldı.
Şampiyonlar Ligi'nde eleme turlarında 2002-2003 sezonunda Hollanda'nın Feyenoord, 2006-2007 sezonunda da Ukrayna'nın Dinamo Kiev, 2010-2011 sezonunda da İsviçre'nin Young Boys takımları karşısında turu geçemeyen Fenerbahçe, UEFA arenasında ise 2010-2011 sezonunda Yunanistan'ın PAOK takımı karşısında üst tur şansı elde edememişti.
Aykut Kocaman ile elemelerde 2 kez takıldı
Fenerbahçe Futbol Takımı, teknik direktör Aykut Kocaman yönetiminde Avrupa kupalarında çıktığı 2 eleme turu mücadelesinde ise tur geçme şansını elde edemedi. Geçen sezon kupalardan men edildiği için Avrupa arenasında boy gösteremeyen sarı-lacivertli ekip, Kocaman'ın ilk yılında 2010-2011 sezonunda UEFA Şampiyonlar Ligi (Young Boys)ve UEFA Avrupa Ligi (PAOK) mücadelelerinde elemelerde rakiplerini geçemedi.
Eleme turu mücadeleleri
Fenerbahçe'nin Avrupa arenasında yaptığı eleme turu maçları ve aldığı sonuçlar şöyle:
Sezon Rakip Sonuçlar
UEFA Kupası
1994-1995 Turan 5-0 2-0(D)
1995-1996 Partizan Tiran 2-0 4-0(D)
1998-1999 Göteborg 1-2(D) 1-0
UEFA Avrupa Ligi
2009-2010 Honved 5-1 1-1(D)
2009-2010 Sion 2-0(D) 2-2
2010-2011 PAOK 0-1(D) 1-1 (Turu geçemedi)
UEFA Şampiyonlar Ligi
1996-1997 M. Tel Aviv 1-0(D) 1-1
2001-2002 G. Rangers 0-0(D) 2-1
2002-2003 Feyenoord 0-1(D) 0-2 (Turu geçemedi)
2006-2007 B36 Torshavn 4-0 5-0(D)
2006-2007 Dinamo Kiev 1-3(D) 2-2 (Turu geçemedi)
2007-2008 Anderlecht 1-0 2-0(D)
2008-2009 MTK Budapeşte 2-0 5-0(D)
2008-2009 Partizan 2-2(D) 2-1
2010-2011 Young Boys 2-2(D) 0-1 (Turu geçemedi)
(Not: Tablodaki sonuçlarda ilk takım Fenerbahçe olarak düzenlenmiştir.)
