"Cim Bom", Türkiye liglerinin en üst kademesinde sadece 1975-1976 sezonunda yer alan Balıkesirspor ile iki kez karşılaştı. 16 Ekim 1975'te deplasmanda oynanan maçı 1-0 kaybeden Galatasaray, 11 Nisan 1976'da İstanbul'daki müsabakayı ise 2-0 kazandı. İki takım, ligde o tarihten sonra ilk kez bir lig maçında karşılaştı.
Galatasaray ile Balıkesirspor, lig maçlarının haricinde Türkiye Kupası'nda iki kez karşı karşıya geldi. İki maçta da rakibini mağlup eden sarı-kırmızılı ekip, 27 Kasım 2012'deki müsabakayı 4-1, 18 Aralık 2013'teki karşılaşmayı ise 4-0 kazandı.